Metoda de lucru consta in multiplex PCR, metoda ce se bazeaza pe tehnologia DPO (Dual Priming Oligonucleotide), patent al companiei Seegene, si anume folosirea unor primeri alcatuiti din doua oligonucleotide unite printr-un linker polideoxiinozina care confera specificitate, sensibilitate si reproductibilitate maxima reactiei PCR.
Timpul de lucru este de 6 ore, mult mai scazut fata de cel al procedurilor conventionale (minim 48 ore pentru culturi), ceea ce duce la initierea mult mai rapida a unui tratament adecvat (de pilda administrarea unui tratament antiviral si nicidecum a unui antibiotic, in cazul unei infectii respiratorii de natura virala).
Sistemul Seeplex permite automatizarea extractiei de acizi nucleici, precum si adetectiei/analizarii rezultatelor, acest lucru nefiind insa restrictiv, putandu-se folosi si varianta clasica de extractie manuala, de detectie in gel de agaroza si de documentare a gelului. La solicitarea dumneavoastra, Novaintermed va poate oferi sistemul semiautomat de extractie Fuji Quick Gene 810, masina de PCR peqSTAR 96 Universal si sistemul automat de electroforezaLAB 901.
Domeniile de utilizare ale truselor sunt urmatoarele:
Detectia de patogeni respiratori (atat virusuri respiratorii ARN si ADN cat si pneumobacterii); de pilda cu ajutorul trusei RV/PB18 ASE Detection se testeaza simultan 18 patogeni: 5 bacterii (Legionella, Streptococcus, Chlamydophila, Haemophilus, Mycoplasma), 13 virusuri dintre care 11 virusuri ARN (Influenta A si B, virusul sincitial respirator uman A si B, parainfluenta 1, 2 si 3, Coronavirus, Rhinovirus, Enterovirus); precum si detectia virusului Influenza A si subtipizarea virusului uman influenza A subtipurile H1 si H3, a virusului avian influenza A subtipul H5 si a virusul porcin influenza A subtipul H1.
- Detectia de patogeni cu transmitere sexuala ce consta in cinci paneluri:
- Panelul pentru screeningul cervicitelor, uretritelor, trichomoniazelor si boala inflamatorie pelvica,
- Panelul pentru sceeningul vaginitei bacteriene,
- Panelul pentru detectia candidozelor,
- Panelul pentru detectia Trichomonas si tipizare HSV,
- Panelul pentru detectia sancrului moale si dur, ulcer si Streptococcus de tip B;
- Detectia HPV prin care se determina prezenta tulpinilor cu risc crescut (minim 14, maxim 16) si cu risc scazut (minim 2, maxim 5) precum si genotiparea tulpinilor 16 si 18 intr-un singur test;
- Detectia tuberculozei ce consta in truse ce identifica prezenta de Mycobacterium tuberculosis, cu posibilitatea de a-l disocia de micobacteria netuberculozica (M.bovis BCG);
- Detectia de Candida (4 sau 8 specii);
- Detectia de HSV 1 si 2;
- Detectia patogenilor implicati in septicemii ce consta din doua grupuri:
- Grupul de screening al bacteriilor gram pozitive (22 specii de Staphylococcus, 24 specii de Streptococcus si 2 specii de Enterococcus),
- Grupul de screening al bacteriilor gram negative (10 specii) si al fungilor (6 specii),
- Detectia de patogeni (bacterii si virusuri) ce cauzeaza meningita umana care consta in trei paneluri:
i. Primul panel pentru detectia simultana de HSV1 si 2, VZV, EBV, CMV, HHV6),
ii. Al doilea panel pentru detectia de Enterovirusuri: Poliovirus, Echovirus, Coxsackievirus),
iii. Al treilea panel pentru detectia de bacterii: Streptococcus penumoniae, Neisseria meningitidis,Haemophilus influenzae, Listeria monocytogenes, Streptococcus de tip B);
- Detectia de patogeni ce cauzeaza diareea consta in urmatoarele paneluri:
- Panelul de detectie de virusuri ARN: Rotavirus, Norovirus GI, Norovirus GII, Enteric adenovirus, Astrovirus),
- Primul panel de detectie bacteriana: Salmonella spp., Shigella ssp., Campylobacter ssp., Vibrio ssp., Clostridium difficile Toxin B,
- Al doilea panel de detectie bacteriana: Clostridium perfringens, Yersinia enterocolitica,Aeromonas ssp., E coli O157:H7, E.coli producatoare de verocitotoxina;
- Detectia de patogeni ce cauzeaza infectia tractului urinar care deceleaza prezenta simultana a 6 bacterii: E.coli uropatogenic, Proteus mirabilis, Klebsiella pneumonia,Staphylococcus saprophyticus, Pseudomonas aeruginosa, Enterococcus faecalis;
- Detectia rezistentei la antibiotice (Enterococcus rezistent la vancomicina, Staphilococcus aureus rezistent la meticilina, H. pilori rezistent la claritromicina, HBV rezistent la lamivudina,Streptococcus agalactiae rezistent la eritromicina/clindamicina;
- Detectie de SNP: CYP2C19, MTHFR C677T, MTHFR C677T/A1298C, ApoE;
- Detectie de mutatii somatice: BRAF, AML1/ETO, BCR/ABL, PML/RARa.